Le carbone α d'un acide aminé est l'atome de carbone central auquel sont attachées une fonction amine(NH2), une fonction carboxyle(COOH), un atome d'hydrogène(H), et un groupe R. Ce carbone est le point de référence pour déterminer la configuration L ou D d'un acide aminé.
Il est asymétrique car il possède 4 substituants.
Les projections de Fischer sont utilisées pour représenter les configurations spatiales des acides aminés. Dans cette représentation, le groupe amine (NH2) est sur la gauche dans les acides aminés de la série L, et sur la droite pour la série D. Les acides aminés présents dans les protéines des organismes vivants sont généralement de la série L.
Les acides aminés peuvent se lier entre eux par des liaisons peptidiques pour former des polymères:
- Dipeptide: 2 acides aminés
- Tripeptides: 3 acides aminés
- Oligopeptides: 20 acides aminés
- Peptides: moins de 100 acides aminés
- Protéines: plus de 100 acides aminés
La liaison peptidique est une liaison covalente qui unit deux acides aminés. Elle se forme lors d'une réaction de condensation entre le groupe carboxyle d'un acide aminé et le groupe amine d'un autre, libérant une molécule d'eau.

Un peptide possède deux extrémités distinctes :
- l'extrémité N-terminale, qui comporte un groupe amino libre,
- l'extrémité C-terminale, qui comporte un groupe carboxyle libre.
Ces extrémités déterminent la polarité de la chaîne peptidique.
Correspond à l'enchainement des acides aminés d'une chaine polypeptidique. Les acides aminés sont reliés entre eux par des liaisons peptidique.
Cette chaine va s'organiser dans l'espace pour former une structure secondaire. Il en existe 4:
- L'hélice alpha
- Le feuillet beta
- Le coude
- La pelote
Elle donne sa forme et ses caractéristiques à la chaine. Structure composée d'hélices(forme de rubans), de feuillets(des flèches) et de boucles. Cette structure est maintenus par des liaisons faibles ( liaisons hydrogène), et des ponts disulfures ( liaisons fortes covalentes) qui stabilisent la structure.
La structure quaternaire concerne l'organisation et l'interaction de plusieurs chaînes polypeptidiques (sous-unités), reliées le plus souvent par des liaisons faibles : hydrogènes, ioniques.