Les microorganismes sont omniprésent dans notre vie ( dans l'eau , l'air , l'alimentations sur et dans notre corps. Certains sont pathogènes responsable de maladies infectieuses et d'autre totalement inoffensif voir utile à l'homme. Notre corps abrite de nombreux microorganisme ( microbiote : de la peau , intestinal , genital..).Le microbiote participe à la protection de l'organisme en constituant une barrière contre les microorganismes pathogènes. La peau et les muqueuses sont des barrières mécanique contre les microorganisme , associé à des barrière chimiques ( larmes,sueur) elles protègent notre organisme. Quand elles laissent entrer les microorganismes dans notre corps il y-a contamination. Les voies de transmissions sont variés les microorganismes peuvent se transmettre par : l'air , l'eau , les aliments , le sang , relation sexuelle non protégés ,la salive ). Dans l'organisme les microorganisme trouve des conditions favorables à leur développent et se multiplie c'est l'infection. Elles peuvent se propager dans tout le corps ( septicémie) ou se développer localement et produire des toxines qui vont envahir le corps.Les virus ont besoin de se pénétrer dans des cellules de l'organisme pour se multiplier. Pour limiter les risques de contamination il faut respecter des règles d'hygiènes en mettant en place des mesures spécifique d'asepsie ou d'antisepsie. Les antibiotiques peuvent stopper des infections bactériennes mais n'ont aucun effet sur les virus.Il est possible de tester l'efficacité d'un antibiotique en faisant un antibiogramme.