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Génétiques des populations

Définition

Génétique des populations
Science qui étudie la transmission des caractères héréditaires au sein d'une population, et leur évolution au cours du temps.

Objectifs de la génétique des populations :

  • Comprendre la variabilité génétique intra/interpopulations
  • Décrire l'évolution des fréquences alléliques
  • Identifier les forces évolutives


Types de polymorphisme :

  • Phénotypique
  • Biochimique
  • Génomique

Mesure de la variabilité génétique

MODELE DE HARDY-WEINBERG (HW)

Les conditions pour ce modèle :

  1. Panmixie ( croisement aléatoires)
  2. Taille infinie (pas de dérive génétique)
  3. Pas de sélection
  4. Pas de mutation
  5. Pas de migration
  6. Générations non chevauchantes


Les limites du modele HW :


  • Aucune population réelle n’est totalement idéale.
  • Utilisé comme modèle neutre de référence pour détecter les forces évolutives (sélection, dérive, migration…).

Panmixie : f(Aa) = 2pq

Homogamie stricte : H(t) = (1/2)tH(0)

Autofécondation : perte rapide des hétérozygotes sur tout le génome

Consanguinité (avec dérive) :

TEST DE CONFORMITE A HW (KHI-2)

Étapes :

  1. Hypothèse H0 : population à l'équilibre HW
  2. Calcul des effectifs théoriques (p², 2pq, q²)
  3. Test du Khi2 :
  4. Comparaison avec la valeur seuil :
  • ddl = n° de génotypes - n° allèles
  • X2 < X2t => on ne rejette pas H0



Forces évolutives et isolement

Forces influençant les petites populations isolées :

  1. Dérive génétique (hasard) : fixation/perte aléatoire d’allèles
  2. Consanguinité accrue : hausse de l’homozygotie
  3. Effet fondateur : échantillon aléatoire fonde une nouvelle pop.
  4. Goulot d’étranglement : réduction brutale de la taille de pop(=> perte d'allèle)


Définition

DÉRIVE GENETIQUE
Fluctuation aléatoire des fréquences alléliques dans les petites populations.

Conséquences :


  • Perte de diversité génétique
  • Risques accrus de maladies récessives
  • Spéciation potentielle

Formule :


Flux de gènes et migration démographique

Définition

Migration démographique
mouvement physique des individus
Flux de gènes
transfert effectif d'allèles entre populations

Impact génétique :


  • Augmente la diversité génétique
  • Réduit les différences entre populations
  • Peut rétablir l'équilibre HW

Parenté et consanguinité

Coefficient de parenté (oij) : proba que 2 gènes soient identiques par descendance

Coefficient de consanguinité (fi) : proba que les 2 allèles chez un individu soient identiques par descendance

Exemple avec 1 ancêtre commun :


Génétiques des populations

Définition

Génétique des populations
Science qui étudie la transmission des caractères héréditaires au sein d'une population, et leur évolution au cours du temps.

Objectifs de la génétique des populations :

  • Comprendre la variabilité génétique intra/interpopulations
  • Décrire l'évolution des fréquences alléliques
  • Identifier les forces évolutives


Types de polymorphisme :

  • Phénotypique
  • Biochimique
  • Génomique

Mesure de la variabilité génétique

MODELE DE HARDY-WEINBERG (HW)

Les conditions pour ce modèle :

  1. Panmixie ( croisement aléatoires)
  2. Taille infinie (pas de dérive génétique)
  3. Pas de sélection
  4. Pas de mutation
  5. Pas de migration
  6. Générations non chevauchantes


Les limites du modele HW :


  • Aucune population réelle n’est totalement idéale.
  • Utilisé comme modèle neutre de référence pour détecter les forces évolutives (sélection, dérive, migration…).

Panmixie : f(Aa) = 2pq

Homogamie stricte : H(t) = (1/2)tH(0)

Autofécondation : perte rapide des hétérozygotes sur tout le génome

Consanguinité (avec dérive) :

TEST DE CONFORMITE A HW (KHI-2)

Étapes :

  1. Hypothèse H0 : population à l'équilibre HW
  2. Calcul des effectifs théoriques (p², 2pq, q²)
  3. Test du Khi2 :
  4. Comparaison avec la valeur seuil :
  • ddl = n° de génotypes - n° allèles
  • X2 < X2t => on ne rejette pas H0



Forces évolutives et isolement

Forces influençant les petites populations isolées :

  1. Dérive génétique (hasard) : fixation/perte aléatoire d’allèles
  2. Consanguinité accrue : hausse de l’homozygotie
  3. Effet fondateur : échantillon aléatoire fonde une nouvelle pop.
  4. Goulot d’étranglement : réduction brutale de la taille de pop(=> perte d'allèle)


Définition

DÉRIVE GENETIQUE
Fluctuation aléatoire des fréquences alléliques dans les petites populations.

Conséquences :


  • Perte de diversité génétique
  • Risques accrus de maladies récessives
  • Spéciation potentielle

Formule :


Flux de gènes et migration démographique

Définition

Migration démographique
mouvement physique des individus
Flux de gènes
transfert effectif d'allèles entre populations

Impact génétique :


  • Augmente la diversité génétique
  • Réduit les différences entre populations
  • Peut rétablir l'équilibre HW

Parenté et consanguinité

Coefficient de parenté (oij) : proba que 2 gènes soient identiques par descendance

Coefficient de consanguinité (fi) : proba que les 2 allèles chez un individu soient identiques par descendance

Exemple avec 1 ancêtre commun :

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