Les peptides

Oligopeptide : 10 résidus maximum (dipeptides, tripeptides...)

Polypeptide : 100 peptides ou plus

Structure primaire : séquence en acides aminés

La liaison peptidique dans l'espace : une liaison plane

• Hybride de résonance (se comporte comme une liaison double)
• Plan rigide, pas de rotation possible autour de la liaison peptidique
• Rotation autour des carbones alpha (sauf la proline)

EXERCICE TD : savoir dessiner trypeptide ; savoir placer Nter/Cter ; calculer pHi

Synthèse peptidique

• In vivo : la traduction
• In vitro : la synthèse peptidique

Modifications post traductionnelles

• Réaction d'un groupement d'un résidu d'acide aminé du peptide
• Des hydroxylations (ajout de OH) des résidus de lysine ou proline
• Des phosphorylations sur les sérines, tyrosines et thréonines
• Des méthylations (ajout de CH3) sur les lysines
• Des acétylations (ajout de CO-CH3) sur les lysines
• Des glycosylations (fixation d'un squelette oligosaccharidique) (N-glycosylation des aspargines ; O-glycosylation des sérines et des thréonines)
• Oxydation de la cystéine et formation d'une cystine (pont disulfure = liaison covalente)

Détermination des séquences peptidiques à l'aide de réaction chimiques et/ou enzymatiques

=> Par hydrolyse chimique (clivage des liaisons peptidiques)

=> Réduction des ponts disulfures par le Bêta-mercaptoéthanol

=> Coupure enzymatique sélectives :

• carboxypeptidase (résidu Cter)
• aminopeptidase (résidu Nter)
• Chymotrypsine (coupe après Tyr, Phe, Trp)
• Trypsine (coupure après Lys et Arg

Séquençage des peptides méthode d'Edman

=> Technique de séquençage des peptides qui permet de déterminer la séquence exacte des acides aminés dans une chaîne peptidique

=> Etapes :

• Fixation de l’acide aminé N-terminal 
• Clivage du premier acide aminé
• Réitération du processus
• Identification des acides aminés

Peptides hormonaux

Plusieurs familles d'hormones

• Stéroïdiennes (cortisol)
• Synthétisées à partir d'un seul acide aminé (T3, T4)
• Peptidiques

Les hormones hypophysaires

• Hormone de croissance (croissance des tissus et os)
• Prolactine (stimule la lactation)
• TSH (thyroïde)
• LH,FSH (gonadostimulines)
• Ocytocine (agit sur les muscles lisses)

Les hormones pancréatiques

• Insuline (hypoglycémiante)
• Glucagon (hyperglycémiante)

Peptides d'intérêt médical

Peptides anti-bactériens (PAM)

• Riche en acides aminés basiques (Lys, Arg) et hydrophobes (Leu, Ile, Phe, Try)

Peptides de pénétration cellulaire

• Déstabilisation de la membrane
• Délivre des molécules thérapeutiques

Peptides anti-viraux

• Inhibiteur de fusion du VIH
• Se fixe à la gp d'enveloppe pour empêcher la fusion

Peptides anti-cancers

• Immunomodulation
• Inhibition de l'angiogénèse

Peptides à utilisation alimentaire

Additif

• Aspartame (pouvoir sucrant)

Compléments alimentaires

• Glutathion (antioxydant)
• Peptides de collagène